《大航海时代Online》中的等级分为3种，战斗等级、交易等级、冒险等级。等级影响到技能格数，驾船的条件，非专业、优待技能的学习条件等。
冒险等级主要依靠：航海距离，发现物报告，委托任务来提升。
交易等级主要依靠：交易所的收益，投资，生产，委托任务来提升。
战斗等级主要依靠：海战，陆战，委托任务。
总之，做喜欢做的事，就可以提高等级。无论初始职业，最终的目标都是全面的航海家。
除了等级，游戏中还有声望的设置，声望影响主线剧情发生条件，可接受的委托任务，爵位，装备物条件等。
声望也分为战斗声望、交易声望、冒险声望。
冒险声望依靠：冒险委托任务，发现物报告来提高。
交易声望：交易委托任务，名产品卖出，投资来提高。
战斗声望：海事委托任务，海战来提高。
可以看出，对于新人，完成初期任务是提高等级、声望最快捷的方法。
